“……那么，这到底是怎么回事呢？”
新岛的沙滩上，面色凝重的青年男子因为意料之外的状况而陷入了迷茫。青年有着一头色彩亮丽的青色头发，按照几十年前的流行款式梳理成类似夜店男公关的模样；至于容貌……客观来讲的话应该也属于“俊俏”的那一类，可是不知为何看上去总给人一种没出息的感觉。
这个人名为不知道姓什么的小次郎，祖籍是关东某地的土豪世家，虽然也就是乡下地主那种程度，但毕竟也是个少爷。因为不想和父母定下的未婚妻结婚而选择与瓦斯弹私奔，流落街头之际遇到了火箭队的拉羊人员，从此加入队伍。于所在小队中因为性别劣势而每天被指使着各种下苦力，地位连只猫都不如的可怜人。
“听你这么一说好像还真是……人都去哪了啊？”
和他并肩站着的女青年也做出一副思考的样子。不过别被她骗了，这个人脑子里根本什么也没在想，只是觉得装成这幅样子可以掩饰自己是个笨蛋的事实。没错，这位耳环尺寸超过精灵球、口红厚度堪比迷唇姐、头发好似充分咀嚼之后吐出来然后绕着手指缠三圈再拽下来使其自然弯曲的大大卷的女性，就是个笨蛋。
她的名字是连姓都没有的武藏，平民家庭出身的稍微有点不良气质的平凡女子，经历了教科书一般惨不忍睹的黑色青春之后，自暴自弃似地从小混混一跃成为恐怖组织成员。
她的扮相时常让人以为是在故意扮老相，可实际上其实是个意外地有少女情怀的家伙，可能是属于她的春天从没来过的缘故吧。另外关于此人还有着一条玄乎其神的谣言，如果让她穿上女仆装的话……不不，什么都没有。
这个曾经在组织内臭名昭著、外号队友粉碎机的三人小组还有一名成员，是一只会讲人话的喵喵，名字……就是喵喵，天晓得它都进化出高等智能了怎么也就没想过给自己取个名字。它曾经只是一只普通的流浪猫，因为爱上了被有钱人家饲养的母喵喵而决意成为“人类一样的存在”，然而最终却以一句“会讲人话的喵喵好恶心”惨遭对方击沉，连好人卡都没领到。心灰意冷之下，离开故乡踏上流浪之旅，机缘巧合之下加入了火箭队。
眼下，这只猫正在和两人分开行动，独自前往基地的控制中心，希望能在那里找到一点线索为这里的诡异情势做出解释。
“——在我们忙着疏通下水道的时候，基地里究竟发生了什么啊……”
虽然早已升格成了干部，但三人的手艺并没有因此生疏，倒不如说因为技艺得到了重视，反而在某种程度上更加精进了——当然，堂堂首领直属部下颠颠地跑去通全基地的马桶这种事情无论怎么看都缺乏合理性，属于这几个家伙的自发行为，简直是烂泥扶不上墙。
若是仅仅如此倒还好，毕竟全组织上下都已经对他们的奇异行为习以为常了，可是今天，当武藏和小次郎打扫完整个基地，确保每一块瓷砖都像喵喵舔过一样干净之后，却发现基地里已经空无一人。
确切地说，也仅仅是没有“人”而已，往常随处可见的火箭队员和研究者们都不见了，取而代之的是形形色色的奇怪宝可梦——它们是少早些时候一次特殊行动的产物，通过火箭队秘密武器·基因大魔王超梦的能力创造出的宝可梦复制品。这些平时应该被关在特定区域里的人工生命正在各处闲庭信步地四处逛荡，仿佛自己成了这座基地的主人。